October 6, 2022

Pada tahun 2020 dan 2021, COVID-19 menjadi penyebab kematian nomor tiga di AS. Mei ini, negara itu melewati tonggak suram dari 1 juta kematian COVID yang diketahui. Meskipun lebih sedikit orang yang meninggal akibat virus sekarang daripada selama puncak gelombang Omicron musim dingin ini atau gelombang sebelumnya, jenis baru terus merenggut nyawa.

Ketika pandemi berlanjut, memahami berapa banyak orang yang sekarat dan siapa yang paling rentan tetap penting untuk upaya mencegah kematian lebih lanjut. Untuk itu, Pusat Pengendalian dan Pencegahan Penyakit (CDC) baru-baru ini memperbarui perangkat lunak yang digunakannya untuk memproses semua data kematian negara tersebut. Perubahan, yang didukung oleh teknik komputasi canggih seperti pembelajaran mesin, dapat memberi pejabat kesehatan dan publik informasi yang lebih terkini tentang penyakit ini.

“Pencatatan sipil kelahiran dan kematian dan pemahaman penyebab kematian benar-benar kunci untuk sistem kesehatan yang berfungsi,” kata Emily Smith, asisten profesor kesehatan global di Universitas George Washington. “Ada banyak cara untuk menggunakan informasi ini.”

Melacak penyebab utama kematian di suatu komunitas dan mengidentifikasi di mana kematian itu terkonsentrasi membantu pejabat kesehatan masyarakat mengarahkan sumber daya, tambahnya. Selama krisis seperti pandemi COVID, memiliki informasi yang cepat sangat penting. Tetapi sistem statistik nasional lambat memproses dan memposting angka kematian. Ketika AS melewati satu juta kematian akibat virus awal tahun ini, pelacak CDC masih tertinggal beberapa minggu.

“Jika datanya tidak tepat waktu, maka kesadaran situasional kita menurun satu atau dua atau mungkin tiga minggu.”

Robert Anderson, Pusat Statistik Kesehatan Nasional CDC

“Tanggapan epidemi yang efektif adalah mendapatkan sumber daya yang tepat—apakah itu obat-obatan atau vaksin atau program pencegahan—kepada orang yang tepat pada waktu yang tepat,” kata Smith. “Data membantu kami melakukan itu.”

See also  Neuron raksasa ditemukan di otak 'penuaan super'

Upgrade CDC merupakan langkah maju yang penting. “Senang melihat AS bergerak maju dengan ini,” catatan Smith. “Data yang lebih transparan dan lebih cepat adalah kemajuan besar.”

Coding COVID-19

Selama beberapa dekade, CDC mengandalkan komputer untuk menganalisis sertifikat kematian dan menetapkan kode empat digit untuk setiap laporan berdasarkan penyebab yang mendasarinya sehingga dapat dilacak oleh Sistem Statistik Vital Nasional.

Namun, hanya sekitar 70 hingga 75 persen dari sertifikat kematian negara yang dapat dikodekan secara otomatis; sisanya ditandai untuk ditinjau, yang berarti seorang anggota staf harus memasukkan penyebab kematian ke dalam sistem dengan tangan. “Ketika Anda berurusan dengan 2 hingga 3 juta kematian [every year]25 hingga 30 persen catatan adalah jumlah yang cukup besar dan membutuhkan sumber daya yang cukup banyak,” kata Robert Anderson, kepala Cabang Statistik Kematian di Pusat Statistik Kesehatan Nasional.

Sistem pengkodean penyebab kematian yang diperbarui, yang dikenal sebagai MedCoder, dapat menangani sebagian besar catatan ini: Saat ini mengkode 85 persen catatan secara otomatis, dan dengan perbaikan berkelanjutan, “memiliki potensi untuk mengkode lebih baik dari 90 persen catatan,” Anderson mengatakan. “Catatan ini dapat dikodekan secara otomatis dalam hitungan menit, sedangkan peninjauan manual mungkin memakan waktu beberapa minggu,” tambahnya. “Itu berarti lebih banyak informasi tersedia secara lebih tepat waktu.”

MedCoder lebih mahir daripada sistem sebelumnya dalam menangani variasi istilah yang digunakan dokter, pemeriksa medis, dan koroner untuk menggambarkan kematian, Anderson menjelaskan. Komputer memberikan salah satu dari 10.000 kemungkinan kode penyebab kematian ke sebuah catatan. Misalnya, ketika COVID disebutkan pada sertifikat kematian, ia memilih U07.1. Untuk meningkatkan hasil, Anderson dan timnya menggunakan teknik pembelajaran mesin yang memanfaatkan data sertifikat kematian nasional selama satu dekade untuk melatih MedCoder mengenali kesalahan dan penyimpangan lainnya. Jadi, ketika dokter mengisi surat kematian dengan “Coronavirus 2019”, “SARS-CoV-2”, “Varian Delta”, atau nama lain penyakit tersebut, komputer tetap mengkodekannya sebagai U07.1. “Sistem lama akan mengatakan, ‘Saya tidak menemukan istilah itu dalam kamus,’ dan menendangnya agar dilihat orang,” Anderson menjelaskan. “[Now] komputer berkata, ‘Oke, saya tahu apa yang harus dilakukan dengan ini dan kode apa yang harus ditetapkan.

See also  Nyamuk yang terinfeksi virus West Nile memecahkan rekor di NYC

[Related: AI confirms the pandemic bummed people out]

Saat memasang pemutakhiran antara 6 hingga 24 Juni, Pusat Statistik Kesehatan Nasional menghentikan pemrosesan data kematian yang dilaporkan oleh negara bagian dan tidak memperbarui kumpulan data pengawasan COVID di halaman publik Sistem Statistik Vital Nasional. Hitungan dari minggu-minggu sebelumnya pada tahun 2022 mungkin sementara tampak rendah sementara sistem mengejar dan memproses ulang catatan-catatan ini, catatan situs web agensi.

“Setelah kita mengatasi backlog ini di sini, sistem akan berfungsi seperti sistem lama,” kata Anderson. “Saya tidak ingin orang khawatir bahwa data yang kami keluarkan sekarang tidak sebanding dengan data yang kami keluarkan sebelumnya. Ini sebanding; itu hanya akan sedikit lebih tepat waktu.”

Angka kematian itu penting

Tidak biasa jika sertifikat kematian menyebutkan varian SARS-CoV-2 mana yang menimpa orang yang meninggal. Tetapi mencari pola dalam data kematian yang lebih tepat dapat membantu para ahli kesehatan memahami betapa berbahayanya jenis baru—dan apakah tindakan pencegahan ekstra diperlukan.

“Jika kematian meningkat, itu meningkatkan urgensi,” kata Anderson. “Jika datanya tidak tepat waktu, maka kesadaran situasional kita menurun satu atau dua atau mungkin tiga minggu.”

[Related: Omicron variants keep getting better at dodging our immune systems]

Ada kemungkinan juga bahwa memiliki data yang lebih cepat akan memungkinkan AS untuk mengakui bahwa itu telah mencapai 1 juta kematian COVID-19 lebih cepat. “Memiliki data real-time yang lebih baik secara hipotetis seharusnya penting di banyak bidang yang berbeda,” kata Smith. “Itu penting untuk persepsi publik; itu penting untuk kemauan politik.”

Kematian yang dilaporkan cenderung tertinggal dari tanda-tanda peringatan lain seperti peningkatan tes positif COVID atau rawat inap. Namun, langkah-langkah ini bisa sulit untuk ditafsirkan. Peningkatan rawat inap dapat menunjukkan bahwa lebih banyak orang menjadi sakit parah, tetapi mungkin tidak menangkap cakupan masalah sepenuhnya karena tidak semua orang dengan penyakit parah memiliki akses ke rumah sakit.

See also  Harapan hidup di AS turun lagi pada tahun 2021

“Itu adalah hasil yang lebih lembut yang menggabungkan tingkat keparahan penyakit dan faktor sosial dan ekonomi lainnya, sedangkan kematian adalah hasil yang sulit.” kata Smith. “Kematian adalah indikator utama—ini hitam dan putih.”